Wapno wykorzystuje się na różnych etapach procesu rafinacji w celu przekształcenia rudy boksytu w tlenek glinu (Al2O3) w postaci proszku o wysokiej czystości, który jest używany jako źródło surowca przez huty aluminium.
Podczas procesu trawienia zawierającej aluminium rudy boksytu wodorotlenek sodu (NaOH), zwany także sodą kaustyczną, jest stosowany do rozpuszczania (trawienia) rudy w warunkach wysokiej temperatury i ciśnienia w celu rozpuszczenia glinu jako rozpuszczalnego glinianu sodu. Część minerałów krzemionki również rozpuszcza się i wytrąca ponownie jako sodalit, znany również jako produkt odkrzemiany.
Proces wytrącania jest ważny, ponieważ usuwa krzemionkę z roztworu. Jednak wytrącanie krzemionki w postaci sodalitu powoduje również utratę sodu (Na+), którego nie można zregenerować jako NaOH. Aby przeciwdziałać tej utracie sodu, niektóre zakłady dodają wapno gaszone do fermentacji, w której Ca(OH)2 powoduje wytrącanie się krzemionki, najlepiej w postaci hydrogranatu, który zawiera raczej wapń niż sód, co zmniejsza utratę sodu w osadach krzemionki.
NaOH stosowany w mineralizacji w wyniku reakcji z materiałem organicznym zawartym w rudzie boksytu oraz w wyniku reakcji z CO2 w kontakcie z powietrzem przekształca się w Na2CO3. Zbyt wysokie stężenie Na2CO3 ma negatywny wpływ na rozpuszczanie się tlenku glinu.
Ca(OH)2 jest używany do przekształcania Na2CO3 w NaOH w reakcji kaustyzacji, redukując w ten sposób Na2CO3 i utrzymując wystarczająco wysokie stężenie NaOH podczas trawienia, aby uniknąć wytrącania się tlenku glinu.
Zakłady Alumina Bayer wykorzystują filtrację w celu usunięcia drobnych (<5 mikronów) zawieszonych cząstek stałych, które nie zostały usunięte w procesie osadzania grawitacyjnego. Filtracja odbywa się przed wytrąceniem tlenku glinu (Al2O3) i ma na celu usunięcie drobnych cząstek żelaza i krzemionki.
Proces filtracji jest wspomagany przez tzw. cząstki „pomocy filtracyjnej” składające się z glinianu trójwapniowego (Ca3[Al(OH)6]2), które powstają w wyniku reakcji niewielkiego strumienia bocznego ługu procesowego o wysokiej wytrzymałości (w temperaturze 95–105oC), zawierającego glinian sodu NaAl(OH)4, z Ca(OH)2 dodanym jako mleko wapienne/zawiesina wapienna.
Wsad rudy boksytowej ze względu na płytkość złóż tych rud zawiera pewną ilość składników organicznych. W procesie prowadzonym w zakładach firmy Bayer większość substancji organicznych w końcu ulega degradacji do szczawianu.
Szczawian jest najbardziej ogniotrwałym związkiem organicznym i jest ważnym zanieczyszczeniem w zakładach firmy Bayer. Niektóre zakłady wykorzystują wapno gaszone do kontrolowania zawartości szczawianu w obiegu poprzez wytrącanie w postaci szczawianu wapnia (CaC2O4.H2O)